على عكس الجولة الأولى، شهدت الجولة الثانية لتصفيات أفريقيا لكأس العالم العديد من المفاجآت غير المتوقعة وأبرزها خسارة غانا أمام جزر القمر

وخسارة جنوب أفريقيا أمام رواندا، بينما كانت الوعكة الحقيقية لمنتخب نيجيريا الذى فشل فى تحقيق الفوز للمباراة الثانية على التوالى بعد تعادله فى الجولة الأولى على ملعبه 1-1 مع ليسوتو، حيث كرر التعادل مرة أخرى مع زيمبابوى 1-1 أيضاً، كما خسرت زامبيا على ملعبها أمام النيجر وتعادلت الكاميرون مع ليبيا ومالى مع أفريقيا الوسطى.

فى المقابل تمكنت 6 منتخبات من تحقيق الانتصار الثانى على التوالى وبالتالى العلامة الكاملة وهى منتخب مصر فى المجموعة الأولى بفوزها الثانى على سيراليون 2-0 بعد الفوز الكبير على جيبوتى 6-0 فى الجولة الأولى، وكوت ديفوار والجابون فى المجموعة السادسة، والجزائر فى السابعة، وتونس فى الثامنة، وجزر القمر فى التاسعة لتتصدر مجموعاتها.

تصدرت السنغال المجموعة الثانية بأربع نقاط ومثلها رواندا فى المجموعة الثالثة والكاميرون فى المجموعة الرابعة، بينما تصدرت المغرب المجموعة الخامسة ولكن بثلاث نقاط نظراً لانسحاب إريتريا من هذه المجموعة واعتبارها مجموعة من 5 منتخبات فقط وهى الفريق الوحيد فى القارة من بين 54 منتخباً منضماً للكاف التى تخلفت عن التصفيات.

وفيما يلى نتائج الجولة الثانية لتصفيات أفريقيا للمونديال

المجموعة الأولى

سيراليون مع مصر 0-2

جيبوتى مع غينيا بيساو 0-1

أثيوبيا مع بوركينا فاسو 0-3

المجموعة الثانية

السودان مع الكونغو الديمقراطية 1-0

توجو مع السنغال 0-0

جنوب السودان مع موريتانيا 0-0

المجموعة الثالثة

زيمبابوى مع نيجيريا 1-1

رواندا مع جنوب أفريقيا 2-0

ليسوتو مع بنين 0-0

المجموعة الرابعة

إيسواتنى مع الرأس الأخضر 0-2

ليبيا مع الكاميرون 1-1

موريشيوس مع أنجولا 0-0

المجموعة الخامسة

إريتريا مع الكونغو برازافيل انسحاب إريتريا

تنزانيا مع المغرب 0-2

النيجر مع زامبيا 2-1

المجموعة السادسة

بوروندى مع الجابون 1-2

جامبيا مع كوت ديفوار 0-2

سيشيل مع كينيا 0-5

المجموعة السابعة

موزمبيق مع الجزائر 0-2

بوتسوانا مع غينيا 1-0

الصومال مع أوغندا 0-1

المجموعة الثامنة

ليبيريا مع غينيا الأستوائية 0-1

مالاوى مع تونس 0-1

ساو تومى مع ناميبيا 0-2

المجموعة التاسعة

مالى مع أفريقيا الوسطى 1-1

تشاد مع مدغشقر 0-3

جزر القمر مع غانا 1-0